しかし、図６−３−３の反射法地震探査結果から地震基盤と考えられる花崗岩類は深度８００ｍ程度以深と予想され、掘削予定深度の５００〜６００ｍ程度では地震基盤まで達するのは不可能と考えられるため、堆積構造に着目した調査ボーリングを実施する計画もある。

その場合は、図６−３−３に示された当初掘削予定地点より南の千秋橋周辺付近（反射法地震探査測線ＲＰ７５付近）までが掘削対象地点となる。

調査ボーリングではＶＳＰ探査（Ｐ波，Ｓ波）、孔径検層・密度検層、音波検層（またはサスペンション検層）、電気検層を実施する予定である。