本調査では，東京都の板橋区舟渡地点・渋谷区代々木地点・千代田区北の丸地点において微動アレイ探査を実施し，その結果と既存資料とを基に地下構造の解明を行い，上記｢東京都地下構造調査｣に資するための地震基盤面及び地下速度構造を把握することを目的として行なわれた。

調査は平成１５年９月より開始し，平成１５年１２月に終了した。

調査の実施にあたっては｢東京都地下構造調査委員会｣を設置し，調査計画，調査結果の評価等において，専門的・技術的指導及び助言を受けた。