初期モデルの各層の深度（層厚）は、アレー近くに地殻活動観測井の試錐データ（孔井一覧を表２−４−６に、位置は図２−４−３６）がある場合は、そのデータを参考とし、試錐データがない場合は図２−４−３７、図２−４−３８、図２−４−３９、図２−４−４０に示した鈴木（１９９６）による各地層の深度や層厚の分布図及び図２−４−４１の楡井（１９８１）による東京湾不整合基底の等深線図等から読み取った値参考にした。なお、平成１２年度屈折法地震探査結果等を参考としたアレーもあり、それらについては個々に記した。

また、初期モデルの各層のＳ波速度は表２−４−５に示す「千葉県：平成１２年度微動アレー調査業務」のＳ波速度や他の資料（一例を図２−４−３５に示した）を参考にした。

設定した初期モデルをもとにｆＧＡによる逆解析を行い、最適解を絞り込んだ。逆解析は、各層の深度とＳ波速度を同時に絞り込んでいくものであるが、試錐データで地層区分と深度が把握されている地点については、出来るだけ層数や深度の調整は行なわずに、初期モデル各層のＳ波速度を求めることを優先した。フィッティングが悪い場合だけ、深度や層数を適宜増減させた。

試錐データがない場合も、図２−４−３７、図２−４−３８、図２−４−３９、図２−４−４０、図２−４−４１から推定される深度と極端にかけ離れることはないと考え、初期モデル各層のＳ波速度を求めることを優先させ、フィッティングが非常に悪い場合は、観測分散曲線の変曲点や勾配などから深度やＳ波速度の目安をつけ、これらをモデル値として解析を行なった。

ただ、微動探査で解析される深度はアレー周辺の平均的深度で、試錐データで確認された深度とは違いがでる可能性があるので、いずれの場合も逆解析に際して深度の固定は行わず、近くに試錐データ等がある場合は１割程度、ない場合は２〜３割の増減の幅をもたせた解析を行った。

なお、Ｓ波速度構造はアレー中心（地表面）からの深度として解析するので、既存資料も全て地表面からの深度に読み替えて解析を行なった。このため、以下の文章中の深度はアレー中心（地表面）又は孔井孔口からの深度（四捨五入してｍ単位）で記し、標高で表す場合だけ注記をつけた。

参考のため千葉県の地質層序を表２−４−７に示した。