試料１０ｇ前後を秤量する。塩酸処理により炭酸塩鉱物を溶解し、遠心分離法により水洗を繰り返して除去する。フッ化水素酸処理により試料中の珪酸質を溶解し、遠心分離法により水洗を繰り返して除去する。残渣沈殿物に重液（ＺｎＢｒ２比重２．２）を用いて鉱物質と有機物を分離させ、浮上した有機物を濃集する。有機物残渣を遠心分離法により水洗を繰り返して洗浄する。有機物残渣に氷酢酸を用いて脱水した後、アセトリシス処理（濃硫酸：無水酢酸＝１：９）を行い植物遺体中のセルロースを加水分解する。その後、遠心分離法により氷酢酸に置換し、さらに遠心分離法により水洗を繰り返して、酸分を除去する。最後にＫＯＨ液（１０％）処理により腐植酸を溶解し、遠心分離法により水洗を繰り返して腐植酸とＫＯＨを十分に除去する。

プレパラートの作成は、タッチミキサーでよく攪拌した直後の残渣液をマイクロピペットで適量とり、グリセリンで封入する。検鏡は、生物顕微鏡のプラン・アポクロマート対物レンズを用い、通常４００〜６００倍（必要に応じて１０００倍）で観察し、木本花粉の合計が２００個体以上になることを目安として、プレパラートの２／３〜全面を走査し、その間に出現した全ての種類（Ｔａｘａ）について同定・計数する。ただし、花粉化石の産出が非常に少ない試料はプレパラート１〜２枚を顕鏡する。

図４−２−２　花粉分析手順