「別府−島原地溝」は、重力の低異常帯であり、全体的に基盤岩の深度が１〜４�qと深くさらにその中には、重力基盤の局所的凹部（地溝）がいくつか認定できる（駒沢・鎌田，１９８５など）。個々の小規模な地溝の形成については、中央構造線の横ずれ運動との関係が示唆されている（楠本ほか，１９９６）。