陸域の島原半島における活断層に関しては、主として空中写真判読による金子（１９７３）、千田（１９７３）、堤（１９８７）、「九州の活構造」（九州活構造研究会編、１９８９）、「新編日本の活断層」（活断層研究会編、１９９１）、国土地理院（１９９１）および「活断層詳細デジタルマップ」（中田･今泉編、２００２）等の文献がある（図３−１、図３−２）。

主な活断層には、次のものがある。

（図３−０）

北部の断層は主に南落ち、南部の断層は主に北落ちであり、全体として地溝状の構造を形成している。

陸域の活断層では、既往文献に示された変位地形の性状からみると、最新の活動は２万年前以後に生じていると判断される。また、鬼界アカホヤ火山灰噴出（７，３００年前：町田・新井、２００３）以後の地溝内の沈降量は１０ｍオーダーに達しているとする研究もある（松岡他、１９９０）。

測地学的観測では、明治以降に年間２ｍｍ程度の沈降が継続していると推定されている（江頭他、１９８７）。これが全て活断層の起震性の活動によるものではないにしても、このようなデータは、ここ数千年間の間にも陸域の断層の活動があったことを示唆している。

しかしながら、本地域においては露頭観察にもとづく活動履歴の検討はほとんどなされていない。