ピットの掘削は平成７年度調査の宇賀川トレンチの北方、約１５ｍの地点である。この付近は前回調査の後、道路が新設されたり、調査場所の水田に池ができるなどなど人工改変が多く、前回と同じ場所または隣接した場所での調査が困難であった。ピットの場所は既存トレンチから類推して、断層の延長上、または下盤側に相当する場所であった。

ピットの地層は、上位から以下のとおりである。

ａ　盛土（木材、瓦礫などの廃材を多数含む、旧耕作土もある）

ｂ 粗砂〜有機質シルト（ピート）互層（ピートには未分解の植物片が多い、沖積相当）

ｃ　砂礫（花崗閃緑岩、または古期堆積岩の小礫を含む、ピット下部のみ）

ｃ層はＥ面底部やＳ面底部にのみ見られる。各々の地層境界は多少の起伏があるものの概ね水平で、ピット内には断層構造は認められない。ピットの南西側が若干低くなる傾向があるが、傾動かどうかは不明である。Ｓ面の下部やＷ面の下部の互層（縦座標−０．３〜−０．５付近）にはわずかに液状化らしい徴候（地層境界の凹凸）がある。これは粗粒層の下面だけでなくピートの下面にもあるため、液状化による乱れと判断される。Ｎ面では互層を斜めに貫く樹根が見られた。

地層の^１４Ｃ年代は、ピット下部の腐植土が９７０±８０、１０９０±７０ ｙＢＰと約１０００ ｙＢＰの年代を示す。しかし、これとほぼ同一層準の砂層が８４０±６０ ｙＢＰ、上位の砂層（ピット中間部）が１４００±７０と最も古い年代を示すなど、ばらつきが大きい。年代試料は生木、樹根を含み、炭化が進んでいない。試料採取には、できるだけ大きな木片を避け、腐植物、あるいは有機質シルトを優先した。　

上記の粗砂〜有機質シルト互層は平成７年度の宇賀川トレンチでも確認されており、年代が１０００ ｙＢＰ前後でばらつく点も同様であった。ピットで見られる互層は、既存の宇賀川トレンチの「Ｄ層（河川堆積物）」に相当すると見られる。トレンチの「Ｃ層（青灰色の軟弱粘土）」に相当する地層は認められない。