トレンチ調査の位置を選定するために、浅層反射法探査の結果をふまえて、計１２孔のボーリング調査を実施した。

地層は下位から、貝殻を多数含む完新世海成砂層，礫層，砂礫層，シルト層（一部有機質土），腐植土・シルト・細砂の互層（Ｓ−５〜Ｓ−２４−５までのスコリア層を挟む），最上位に洪水性の砂礫と宝永テフラが分布する。また、大半のボーリング孔で深度５．５〜７ｍ（標高８〜９ｍ）付近の泥炭層中に層厚数�o〜２�pの火山ガラスを含む白色火山灰の薄層が認められた。１４Ｃ年代は３４３０±９０ｙＢＰであった。

白色火山灰及びその上下のスコリア層の対比図によると、白色火山灰層はＢ２−４〜Ｂ２−１０の間でほぼ水平であるが、Ｂ２−１０〜Ｂ２−２間で４１ｃｍ、Ｂ２−２〜Ｂ２−１間で５３ｃｍ、計９４ｃｍ西落ちの高度差を示している。また、その上下の７枚のスコリア層も、それぞれ３４〜９７ｃｍ、東上がりの高度差を示す。

完新世海成層上面は緩い起伏があり、標高−０．７〜＋１．９ｍにある。Ｂ２−４〜Ｂ２−１間の深度１．５〜３ｍ付近には、最近の洪水時の堆積物とみられる砂礫層が不整合で分布する。